Un rapport du Centre national de référence (CNR) hantavirus, rattaché à l'Institut Pasteur, révèle que le virus Seoul, une souche d'hantavirus distincte du variant Andes qui a récemment perturbé la planète via le cas du « MV Hondius », circulait en 2023 parmi la population de rats à Bordeaux. Ce document, vieux de trois ans et passé sous les radars, indique que cette souche, bien que radicalement différente, était déjà présente en Nouvelle-Aquitaine.
Une circulation discrète mais réelle
Selon le rapport annuel d'activité 2023 du CNR, seulement 50 cas humains d'infection récente par un hantavirus ont été recensés en France métropolitaine cette année-là. Ces contaminations rares étaient concentrées dans des foyers traditionnels comme l'Avesnois, l'Aisne et les Ardennes. Cependant, les experts détaillent également les résultats du projet national RATVAR, une vaste étude de terrain visant à recenser les pathogènes à potentiel zoonotique portés par les rats en milieu urbain.
Bordeaux dans le viseur
L'objectif de RATVAR est d'appréhender les risques sanitaires que les rats bruns (rattus norvegicus) font courir à la population. Bordeaux figure parmi les quatre villes où l'expérimentation a été menée, sur une dizaine participant au projet. Les investigations révèlent que le virus a été détecté avec une prévalence de 7,9 % (6 rats positifs sur 76). À Lyon, l'autre ville où il a été observé, la prévalence atteint 36 %.
Bien qu'il s'agisse de la souche Seoul, qui se transmet de l'animal à l'homme mais reste incapable de se propager d'un individu à l'autre, contrairement au variant Andes, cette donnée confirme que le Sud-Ouest n'est pas exempt de ces pathogènes.
Une surveillance nécessaire
L'identification du foyer bordelais illustre la nécessité d'une surveillance locale accrue. Les rédacteurs du rapport soulignent que ces études devraient permettre de mieux évaluer la circulation du virus Seoul et sa diversité génétique au sein des populations urbaines de rats. S'il n'y a pas de raison de céder à la panique, ce document atteste que des hantavirus endémiques circulent bien dans les égouts de Gironde, rappelant l'importance de lutter contre la prolifération de ces rongeurs.
